色谱柱的安装会影响气相分析的重复性。具体来说，毛细柱的安装长度是有严格要求的，如果毛细柱安装长度的改变，将影响气相色谱分析的重复性。另外，毛细柱安装位置不正确，会导致灵敏度严重下降，甚至于待检物质不出峰。

因此，在安装毛细柱时，应确保毛细柱的柱头能够伸入到衬管的合适位置，并控制好毛细柱的安装长度。同时，如果样品中有两个组分同时从色谱柱里跑出来，重叠的峰会影响分析结果，这时可以通过调整前处理方法、改变色谱条件等方法来使重叠的峰分开。